يساعد خل الزعتر على علاج السعال الديكي والألتهابات الشعبيه ، والربو، والبلغم . كما يساعد على تسهيل خروج المخاط الشعبي فيهدئ الشعب الهوائية ويلطفها .حيث يشرب منه خل الزعتر ويستخدم زيته أيضا في دهن الصدر قبل النوم .
يعتبر خل الزعتر مسكن للألم ومطهر ومنشط للدورة الدموية
يعالج خل الزعتر إلتهابات المسالك البولية والمثانة ويشفي من مرض المغص الكلوي ويخفض الكوليسترول .
يساعد خل الزعتر على طرد الغازات من المعدة ومنع التخمر كما يساعد على الهضم وامتصاص المواد الغذائية .
طارد للفطريات والطفيليات مثل الأمبيا المسببه للدوسنتاريا ،وقاتل للميكروبات نظرا لإحتوائه على مادة الكارفكرول .
يعتبر خل الزعتر قابض حيث يعالج حالات الإسهال .ويفضل أن يؤخذ الزعتر مع زيت الزيتون .
يساعد خل الزعتر على تنشيط جلد الراس ومنع التساقط وتكثيفه .